有氧呼吸的第三阶段是氧化磷酸化过程，也称为终期氧化。在这个阶段，通过无氧糖酵解和有氧呼吸得到的半乳糖酵解产物、糖酵解产物和脂肪酸等有机物在线粒体内被氧化成二氧化碳和水，并释放出大量的能量。这一过程产生了能量梯度，推动氢离子跨越线粒体内膜向外运输。随着氢离子流经ATP合酶复合物，它们推动这个复合物进行机械运动，并催化ADP与无机磷酸盐结合生成ATP分子。
有氧呼吸的第三阶段是氧化磷酸化过程，也称为终期氧化。在这个阶段，通过无氧糖酵解和有氧呼吸得到的半乳糖酵解产物、糖酵解产物和脂肪酸等有机物在线粒体内被氧化成二氧化碳和水，并释放出大量的能量。
在线粒体的内膜上存在着一系列的蛋白质复合物，它们通过电子传递链（ETC）将氧化过程释放的电子逐步传递给氧气分子。这一过程产生了能量梯度，推动氢离子跨越线粒体内膜向外运输。随着氢离子流经ATP合酶复合物，它们推动这个复合物进行机械运动，并催化ADP与无机磷酸盐结合生成ATP分子。
因此，有氧呼吸的第三阶段实际上是将有机物从糖和脂肪酸转化为ATP能量的过程。通过氧化磷酸化，一个葡萄糖分子可以产生约36-38个ATP分子，一个脂肪酸分子可以产生更多的ATP能量。
总结起来，有氧呼吸的第三阶段能量转化主要包括以下过程：
1. 糖酵解产物、脂肪酸等有机物经线粒体内膜进入线粒体；
2. 通过氧化酶的作用，有机物被氧化成二氧化碳和水，并释放出电子；
3. 电子通过电子传递链传递给氧气分子，形成能量梯度；
4. 梯度推动氢离子跨越线粒体内膜，并通过ATP合酶复合物生成ATP分子。